Czyste kultury bakterii, populacja bakterii należących do tego samego gatunku.
Aby wyizolować czyste kultury bakterii, stosuje się wielokrotne dyspersje mieszanej kultury na gęstej pożywce. W tym procesie kolonie bakterii rozwijają się zazwyczaj z jednej lub wielu komórek tego samego gatunku. Potomstwo pojedynczej komórki wegetatywnej, zwane klonem, tworzy kolonię charakterystyczną dla danego gatunku. Aby zapewnić gromadzenie się komórek określonego gatunku bakterii, stwarza się optymalne warunki do rozmnażania tego gatunku i niekorzystne dla innych gatunków (odpowiedni skład i odczyn pożywki, temperatura, napowietrzanie pożywki itp. Czysta hodowla jest niezbędna do badania właściwości morfologicznych, fizjologicznych i serologicznych, których całokształt określa tożsamość gatunkową badanego mikroorganizmu. W przemyśle winiarskim do fermentacji malolaktycznej stosuje się czyste kultury bakterii kwasu mlekowego Leuconostoc gracile, Leuconostoc oenos, Lactobacillus plantarum.